现在粮食、农药、农具、化肥等与农业有关所有的东西都在涨价，唯有种子的价格涨不上去？这是目前种业上市公司普遍面临的问题。
据相关数据报道，隆平高科2005年至2007年第三季度业绩报告显示，除去房地产项目等投资收益，主营业务收入和净利润都呈下降态势。无独有偶，同期登海种业对应的指标也显示出这种状况。另外，与登海种业同样从事玉米种子的敦煌种业主营收入和净利润同期也呈现下降态势。
隆平高科的董秘彭光剑表示，隆平高科的主要产品杂交水稻种子虽然一直处于世界最先进水平，但近三年国内的市场占有率从超过30%下降至目前的不到20%。
彭光剑曾任湖南省原子能农业应用研究所副所长，从事种业工作将近20年，是隆平高科公司内部种业方面少数几个最具权威的专家之一。对于种业的现状，彭光剑一言概括为，“是千军万马搞育种的结果。”
资料显示，中国种子经营机构众多，其中既有国有种子公司(主要是按照行政区域设置)，也有其他各种类型的种子公司，如各级科研院所和育种站等。截至目前，种子公司总计超过10万家，种子的生产、加工和销售机构的平均年销售额仅有450万元；年销售额超过 2000万元的种子企业不到100家，超过1亿元的仅有7家；目前还没有净资产超过10亿元或种子年销售收入超过10亿元的公司。
个人从事种子销售，从事育种，可以租地培育，基本没什么投入，而注册资本金实际上也有操作空间，实际门槛非常低，虽然在湖南格塘镇从事种子销售的有十几家，但专门从事种子销售超过5年的很少。有些新出现的种子公司往往以次充好，虽有质量问题，但等发现了也是几个月之后，而这些公司出了问题会注销原公司，重新在其他地方开设新公司。
望城县，全县有几百家种子经营公司，但并没有发现有专门从事种子监管的机构。对此县政府办公室一位工作人员告诉《证券市场周刊》，其实对种子公司的监管很难，因为目前市场上的种子品种太多，县里不具备检测技术；更重要的是，农民普遍没有自我保护意识，除非发现假种子，对于以次充好的种子，一般不向上反映。
监管难题确实存在，据隆平高科不完全统计，目前每年各省都有20多个，全国总计有100多个杂交水稻新品种通过审定。不过，国家一直极为重视“三农问题”，而种子又关系到农民的切身利益，行业监管的空白应该引起政府的重视。
